AutormaUserManual
1. 简介
2. 使用背景
3. 安装指南
4. 软件界面
5. 快速开始
6. 功能详解
7. 案例实践
8. 常见问题与故障排除
AutormaUserManual
欢迎使用AutoRMA
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欢迎使用AutoRMA
1. 简介
1.1. 开发背景
1.2. 软件介绍
1.3. 历史版本
1.3.1. AutoRMA-Lite 版本记录
1.3.2. AutoRMA-Full 版本记录
2. 使用背景
2.1. ReaxFF 模拟产物简介
2.2. 分析文件简介
2.2.1. 物种文件(species.out)
2.2.2. 键序文件(bonds.reaxc)
2.2.3. 轨迹文件(dump.lammpstrj)
3. 安装指南
3.1. 系统要求
3.2. 下载
3.3. 安装
3.4. 激活注册
3.4.1. 获取激活码
3.4.2. 激活步骤
3.5. 查看许可信息
3.6. 续费和升级
4. 软件界面
4.1. 标题栏
4.2. 菜单栏
4.3. 工具栏
4.4. 中心部件
4.5. 状态栏
5. 快速开始
5.1. 生成 LAMMPS param.qeq 文件
5.2. 生成 LAMMPS data 文件
5.3. 创建 Species-Based/基于物种 项目
5.4. 创建 Bonds-Based/基于键序 项目
(仅 AutoRMA-Full)
5.5. 打开已有项目
6. 功能详解
6.1. 创建项目
6.1.1. 文件格式要求
6.1.2. 自动识别同目录文件
6.1.3. Optional Settings/可选参数
6.1.4. 原子详情配置
(仅 Bonds-Based/基于键序 项目)
6.2. 分析结果概览
6.3. 界面交互
6.3.1. 表格操作
6.3.2. 导出与设置
6.3.3. 版本管理与重用
6.4. 界面高级设置
6.4.1. 主题切换
6.4.2. 界面语言切换
6.4.3. 激活信息查询
7. 案例实践
7.1. 数据目录结构
7.2. 案例一:力场参数提取
7.3. 案例二:初始结构建模与转换
7.4. 案例三:Species-Based/基于物种 分析
7.5. 案例四:Bonds-Based/基于键序 分析
8. 常见问题与故障排除
8.1. 无法进入软件
8.2. 版本过旧
8.3. LAMMPS 数据分析问题
8.3.1. 新建项目错误
8.3.2. 打开项目错误
8.3.3. 分析结果错误
8.4. 提取力场参数失败
8.5. 转换data文件失败
8.6. 轨迹可视化卡顿或崩溃
8.7. 联系支持