1. 简介
1.1. 开发背景
反应分子动力学（ReaxFF MD）是在分子尺度研究化学反应机理的常用方法，可通过势函数描述化学键的形成、转变与断裂。
ReaxFF 适用于大规模体系（>10000 原子），但面对超大规模模拟结果时，依赖人工进行机理分析往往耗时且不具可扩展性。因此，AutoRMA 应运而生，旨在提供便捷、可定制的 ReaxFF 结果分析与可视化能力，帮助研究人员高效提取关键反应机理信息。
1.2. 软件介绍
AutoRMA（Automatic Reaction Mechanism Analyzer）是用于自动化分析 ReaxFF 反应机理的软件工具。
当前提供两个版本：AutoRMA-Lite 与 AutoRMA-Full（后文若无特别说明，统称为 AutoRMA）。
AutoRMA-Lite（轻量级）
面向物种（species.out）文件分析，支持基础的物种变化统计与可视化，适合快速完成反应过程的初步研判。
推荐场景：
主要关注物种（分子）浓度变化趋势
需要快速进行初步反应机理分析
不需要详细的反应路径与键断裂过程
学习、教学或方法验证场景
AutoRMA-Full（完整功能）
在 Lite 版本基础上，新增以下能力：
键序（bonds.reaxc）文件分析：追踪原子间化学键的动态变化，识别键的形成与断裂
轨迹（dump.lammpstrj）文件可视化：提供 3D 可视化能力，展示分子动态行为
反应路径识别：自动识别并追踪反应路径
高级统计分析：提供更丰富的数据分析与图表展示功能
推荐场景：
需要深入研究反应机制与反应路径
需要追踪化学键动态变化过程
需要 3D 可视化展示分子动态行为
需要分析局部区域或复杂多步反应过程
需要识别反应中间体与过渡态
面向学术发表、工业应用或产品开发的深入分析
1.3. 历史版本
1.3.1. AutoRMA-Lite 版本记录
版本号
发布日期
支持平台
更新信息
2.0.0
2025.03.27
Windows
首次发布
2.0.1
2025.04.10
Windows
支持在物种文件中进行原子类型合并分析
2.0.2
2025.04.13
Windows
修复通过元素周期表添加原子时导致的卡死问题
2.1.0
2026.04.11
Windows
优化界面交互体验
2.1.1
2026.04.12
Windows
修复更新版本错误问题
2.1.3
2026.04.18
Windows
修复版本更新错误问题
1.3.2. AutoRMA-Full 版本记录
版本号
发布日期
支持平台
更新信息
2.1.0
2026.04.11
Windows
首次发布，支持键序分析、轨迹可视化
2.1.1
2026.04.12
Windows
修复更新版本错误问题
2.1.2
2026.04.14
Windows
修复分子二维视图无法点击问题；优化追踪视图交互体验；修复机器码生成问题
2.1.3
2026.04.18
Windows
修复版本更新错误问题