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反应分子动力学(ReaxFF MD)是研究复杂化学反应机理的前沿技术，通过势函数描述化学键的动态变化，适用于大规模系统(上万个原子)。然而，分析大系统模拟结果面临巨大挑战，难以捕捉化学反应细节。AutoRMA(Automatic Reaction Mechanism Analyzer)基于Lammps(ReaxFF MD)模拟结果，自动提取分子和化学反应信息，并通过友好的用户界面提高系统分析的效率和精度及交互性，为科研人员提供了一个强大且易于使用的工具。
ReaxFF能够模拟化学反应中分子的动态变化。物质(化学分子式)数量的变化趋势是反映化学反应进程和动力学特性最直观的指标。通过跟踪这些变化，可以清晰地识别反应中间体和最终产物，以及它们的生成和消耗速率。这种数据对于评估反应的热力学和动力学性质至关重要，例如计算反应速率常数和活化能等关键参数，以及用于研究材料的稳定性、降解过程和新相的形成。这不仅有助于深入理解反应机制，还能为实验设计和工业应用提供理论支持。
ReaxFF模拟通过输出键序文件和轨迹文件，为化学反应的详细分析提供了关键数据。键序文件记录原子间键的动态变化，帮助识别键的形成与断裂，从而揭示反应路径和中间体。轨迹文件则提供原子的精确坐标，可用于可视化分子的动态行为。这有助于深入理解反应机制，如分析反应路径和识别过渡态等。此外还可以进行局部区域的反应追踪，对指定区域内的化学反应进行详细分析。这些功能使得ReaxFF在复杂化学反应体系的研究中具有独特优势
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